Одним з найбільш відомих шляхів профілактики є вакцинація, при якій вводяться ослаблені або вбиті мікроби для того, щоб в майбутньому захистити від даного мікроба і попередити розвиток хвороб. Вакцинація (її ще називають імунізацією, або щепленням) дозволяє запобігти смертельні інфекційні захворювання, такі як дифтерія , правець , поліомієліт та інші. Вакцинацію найчастіше проводять в ранньому віці, оскільки вона забезпечує захист від багатьох захворювань на все життя. Стандартні вакцини вводяться дітям молодшого віку проти наступних інфекцій:
- дифтерія;
- правець;
- коклюш;
- кір;
- поліомієліт;
- туберкульоз;
- гепатит В;
- гемофільна b-інфекція.
Крім того, розроблені нові ефективні, але поки недостатньо використовуються вакцини проти:
- ендемічного паротиту;
- краснухи;
- пневмококової інфекції;
- ротавірусної інфекції.
У таблиці нижче вказано, в якому віці і якими вакцинами потрібно вакцинувати дітей для того, щоб захистити від основних інфекцій. Зазначені вакцини вводяться в основному в дитинстві. Однак слід пам'ятати, що вакцинуватися потрібно і особам старшого віку. Наприклад, після 16 років кожні 10 років рекомендується вакцинуватися від правця. Літнім людям необхідна щорічна вакцинація проти грипу на початку осені. Крім того, людям похилого віку рекомендується пневмококової вакцина.

З часу створення першої вакцини від віспи Едвардом Дженнером пройшло більше 200 років. За цей час за допомогою різних вакцин вдалося запобігти смертельні інфекційні захворювання у мільярдів людей на планеті. За допомогою вакцинації в світі була знищена віспа і успішно ведеться боротьба проти таких небезпечних захворювань, як поліомієліт і дифтерія.
Незважаючи на очевидність того, що вакцинація є життєво необхідною, безпеку і доцільність цієї процедури продовжує викликати численні суперечки. Згідно Всесвітньої Організації Охорони здоров'я, кожна дитина має право на попередження захворювань, які можна уникнути за допомогою вакцин. У сучасному світі ми рідко стикаємося з такими хворобами, оскільки їх ефективно попереджають за допомогою вакцинації. Це створює враження, що людство більше не потребує вакцинації, що є серйозною помилкою.
Міфом є і те, що вакцинація послаблює імунну систему. В даний час тому не існує доказів. Навпаки, вона підсилює імунну систему проти захворювань, від яких вакцинуються. Щорічно за допомогою вакцинації запобігають такі захворювання, як кір, дифтерія, правець, поліомієліт у мільйонів дітей, від яких вони могли б загинути або стати інвалідами.
Деякі вважають, що занадто багато вакцин несприятливим чином відбивається на імунній системі дитини. Наукові дослідження показують, що до 2-річного віку можна вакцинувати дитину до 23 разів. За один візит до лікаря допустимо введення вакцин до 5 разів. Іноді можуть спостерігатися алергічні або інші реакції, але їх небезпека незначна в порівнянні з мільярдами бактерій і вірусів, з якими ми стикаємося в навколишньому просторі. Помилкою є те, що немає необхідності вакцинуватися від таких малонебезпечних хвороб, як свинка або вітрянка. Дійсно, більшість людей легко переносять зазначені хвороби, а також кір або коклюш. Однак у деяких осіб зазначені захворювання можуть викликати серйозні ускладнення, які можуть призводити до смерті. Тому попередження будь-яких інфекційних хвороб, навіть малонебезпечних, є дуже важливим, особливо якщо проти них існує вакцина.
Деякі вважають, що в сучасному світі інфекційні хвороби більше не уявляють такої загрози, як це було раніше. Це не так. Справа в тому, що загрози інфекцій значно зменшилися саме завдяки вакцинації. Відомо безліч випадків, коли через припинення програми вакцинації або через використання неякісних вакцин виникали епідемії захворювань, про які стали навіть забувати. Тому виключно важливим є те, щоб діти отримували повну серію вакцин, які рекомендує лікар.
Не всі вакцини забезпечують повну довічну захист від інфекцій. Помилкою слід вважати те, що отримавши вакцини в ранньому віці, дитина повністю захищений від інфекцій на все життя. Деякі вакцини вимагають повторного введення через певний проміжок часу після початкової вакцинації. Багато вакцини, наприклад АКДС, вводяться кілька разів в ранньому віці. Однак в подальшому деякі вакцини вимагають повторної вакцинації, з тим щоб забезпечити повний захист від таких хвороб, як кір і дифтерія.